基因檢測
基因檢測
分子遺傳學檢測
分子遺傳學檢測

  有癥狀個體的分子診斷測試變得越來越復雜。直到最近,這種測試最多只在一個或幾個基因座上進行。出現大插入克隆陣列,并且,以后,寡核苷酸陣列通過使患者的整個基因組以改善的分辨率進行查詢,從而允許檢測介質的大基因組的病變改變這種景觀。如今這可以單核苷酸分辨率得益于更便宜,更快,更加準確whole-在做外顯子組測序和全基因組測序。盡管基因組測序有望改變診斷方法,但非測序分子技術對于有效,準確地篩選和確定變異仍至關重要。患者和家庭依靠分子診斷來進行醫療保健管理,疾病預后和計劃生育,提供有關患病條件的答案時,他們將對個人有益。在圍繞這些進步的欣喜之中,出現重大的分析和解釋挑戰,從驗證患者中大量基因組變化到該方法的經濟可行性及其在標準護理中的部署,再到管理以太字節計的數據,伴隨著單個測序的基因組。解密鎖定在患者基因組中的信息并非易事。然而,這種努力朝向可立即適用于普通和罕見的遺傳病有通知寬范圍的臨床表型的潛在信息學和分子工具的開發投入了。在這里回顧一系列可用于分子診斷的方法,它們在檢測基因組變異中的相對價值以及每種技術的一些關鍵挑戰。瞬息萬變的技術平臺,直接閱讀其他文章為比較新一代測序和其他基因組技術評論。此外,討論將技術應用于臨床實踐的挑戰,包括政策制定和道德考量。盡管將審查的重點放在美國的實驗室測試上,因為它是政策討論和技術開發的重點,但腫瘤基因檢測網提出在資源有限的其他國家和地區中要考慮的方法。與癌癥或病毒載量基因檢測中的體細胞突變相比,還專注于可遺傳基因型或核型的基因檢測。涵蓋新生兒篩查技術,血統測試或身份DNA測試;產前基因檢測和倫理方面的考慮的學術討論。首先討論遺傳服務和應用以及當前相關技術的范圍。然后,將重點放在對基因組變異的具有挑戰性的解釋上,特別是在WGS和WES的新生使用中。最后,腫瘤基因檢測網討論臨床基因組測序的考慮范圍和社會意義,包括獲取,倫理學,遺傳學教育和監管情況。在本綜述的結尾,將下一波基因組測序整合到臨床實踐中的挑戰。
   基因檢測已經從一個小眾專業的罕見疾病發展到復雜疾病和個人使用的應用范圍很廣。毫不奇怪,隨著應用程序的發展,基因檢測的定義也發生變化。臨床基因檢測的應用涵蓋醫學領域,包括:新生兒篩查高滲透性疾病;遺傳性疾病的診斷和攜帶者檢測;成人發作和復雜疾病的預測性和癥狀前檢測;和藥物遺傳學測試以指導個別藥物的劑量,選擇和反應。當前,基因檢測可能會在不同的臨床環境中進行指示,并由多家醫療服務提供者下達命令。個別基因檢測的情況將指導測試和測試平臺的選擇。例如,產前WGS可以檢測多種罕見遺傳疾病的攜帶者狀態但對于常規篩查可能不切實際。資金短缺地區的基因檢測可能會繼續以患者的表型為基礎,由候選基因方法來驅動,這在美國已經有二十年的范例了。盡管如此,方法在某些經典的單基因綜合征和以前具有分子原因的家庭中仍具有重要作用。但在天真的情況下進行基因檢查時,可以提出一個論點,全基因組分析對于確定突變負荷和確定與健康計劃相關的其他遺傳因素可能是有價值的。在大多數情況下,臨床分子診斷技術仍然專注于識別患者潛在的致病機制。通過直接基因檢測,實驗室將尋找有助于某種疾病發生的特定遺傳變異,而間接遺傳測試則依賴于對與目標性狀相關但不會引起遺傳疾病的DNA標記進行比較。技術的每一次轉變都伴隨著對評估新診斷平臺的質量和可行性的需求。分析有效性是對分子測試檢測遺傳或基因組變異的能力的一種度量,包括檢測的分析靈敏度和分析的分析特異性。相比之下,臨床有效性是指測試預測臨床狀況是否存在的能力。
   盡管在資金充裕的實驗室中涌現新技術以詢問患者的致病變異,但在資源更有限的世界區域中,間接方法仍繼續在診斷中發揮重要作用;可以應用使用單核苷酸多態性和短串聯重復序列的連鎖分析。經典的間接方法,變性梯度凝膠電泳和異源雙鏈分析已在美國逐步淘汰,但技術仍在資源有限的發展中地區得到廣泛使用。間接測試可以通過縮小關注區域來提供全基因組數據。這是研究中通常用來節省WGS成本的方法。對于專業應用,例如非侵入性產前檢測和植入前遺傳學診斷,以放大并從軌跡樣本或者甚至單個細胞分化的STR的能力使得微連鎖分析有吸引力的方法。與限制酶切消化,雜交或其他檢測突變的方法相結合的擴增仍是臨床分子診斷中最便宜,最可靠的方法之一。PCR突變檢測的簡便性使多個樣品的通量變得可行,并為檢測變異提供高可信度。例如經常通過直接擴增重復片段測試常見的引起疾病的重復擴增,例如脆弱X綜合征中。這種方法是理想的,用于對公共變體,例如一個簡單的Taqman測定法藥物遺傳學變異或因子VLeiden突變的基因分型檢測法。當然等位基因特異性PCR的缺點是無法檢測尚未測定的任何相關變體。方法仍具有很高的價值,特別是在資源有限和無法使用先進儀器的實驗室中,并且有可能仍是核心的臨床檢測方法。為了檢測點突變和小變異,雙向測序被認為是臨床基因檢測中的“黃金標準”。這種直接方法具有高分析有效性,雖然長讀取會惡化為基礎呼叫質量和分鐘標本可以產生PCR假象。直接測序一個或多個完整基因的基本價值是將候選基因的臨床適應癥與測定的高靈敏度和特異性相結合的能力。例如,對單個基因可以以相當低的成本確認或排除對阿珀特氏綜合癥的診斷,對TCOF1進行測序可檢測出TreacherCollins綜合征患者中高達90%的突變,同時測試已知會導致Noonan氏綜合癥的六個基因在30%具有臨床特征提示Noonan綜合征的個體中檢測到突變。隨著全基因組技術分析有效性的提高,基因組測序可能會成為遺傳分析的第一道手法,以告知候選基因Sanger測序。盡管Sanger測序具有很高的分析有效性,但該方法的臨床有效性取決于疾病的遺傳驅動因素。Sanger測序無法檢測到大多數結構變化,因此僅憑其不足以診斷許多遺傳疾病。
   基于微陣列的基因分型可以分為三個主要應用:檢測結構異常的陣列比較基因組雜交,表型特異性SNP面板和全基因組SNP面板。在學術和商業實驗室努力產生含有已知以驅動特定表型的等位基因,如視網膜變性面板特定表型的面板。這種方法的實用性是,詢問多個基因的低成本,快速實驗可以提供高質量的分子診斷。然而,不斷發現新的因果等位基因和基因,以及可變的外顯率已知突變的表達和表達限制了這種方法的臨床有效性。與此相反,大型全基因組SNP基因分型提供了一個單一的,成本高效的平臺,以評估在一個測試用可變記錄關聯多個公共遺傳疾病的風險。預測和癥狀前測試可作為多種疾病的多重平臺使用,包括某些癌癥和藥物遺傳學測試,以及眼科,心臟,腎臟和神經系統疾病。個人基因組公司現在提供的商業臨床基因分型服務提供給消費者,如版本的個人基因組服務從23andMe公司,途徑基因組學和Navigenics公司。盡管測試是為消費者設計的并且可供消費者使用,但是由于分析測試是在臨床實驗室中進行的,因此臨床醫生也可以訂購此類全基因組SNP測試。使用全基因組SNP測試,可以以較高的分析有效性評估特定的基因座,但變異檢測的范圍有限,只能將分析限制在基因組中的預選點上。此外,由于陣列可識別有限范圍的變異,因此大多數基于SNP的診斷具有概率性,而不是確定性,具有不同的臨床有效性。例如年齡相關性黃斑變性的兩個主要基因座上的常見等位基因純合性有疾病發作的高概率值和在患者管理由于一些SNP的純合性和吸煙的記錄高關聯可能誘導行為改變,但測試具有預測能力有限AMD本身。較新的雜交平臺,例如包含在患者和對照個體中均報告的所有已知編碼變體的外顯子組芯片,可能會提高識別與疾病狀況相關的罕見和常見等位基因的患者突變負荷的效率,盡管它們也可能臨床有效性有限。
   化學和顯微鏡技術的最新進展已大大提高細胞遺傳學的分辨率,最顯著的是通過開發了多探針熒光原位雜交技術和染色體CGH。除了經濟因素外,細胞遺傳學方法在臨床上逐漸被淘汰,轉而采用結合SNP陣列CGH的方法,該方法使用探針來檢測染色體和基因組重排以及與FISH相比具有更高的準確性和更小的基因組變異的缺失。根據設計和探針密度,陣列CGH可以提供從整個染色體到大小為千堿基的缺失和重復的分辨率。陣列CGH可提高重排檢測的靈敏度,并具有檢測容易通過染色體CGH無法檢測到的單親二體性的能力。同時,分辨率的提高伴隨著亞顯微基因組重排檢測的大量增加,而亞顯微基因組重排對被測患者的臨床表型沒有明顯的重要性。使用Ensembl資源的人類染色體染色體失衡和表型數據庫等資源和細胞基因組陣列協會國際標準正在對亞顯微缺失和重復進行分類,這些缺失和重復可能影響劑量敏感基因的拷貝數或破壞正常基因表達,從而導致疾病。這些數據庫用于輔助的常新穎的和經常的解釋提供一個共同的貯庫從頭結構變化的診斷中發現。即便如此,所沉積的表型數據的不均勻沉積還是對此類數據庫的實用性構成了實質性限制。同時,其他分子技術檢測不同大小和復雜性的亞染色體重排的能力也呈指數增長。Southern印跡法過去曾與限制性片段長度多態性結合廣泛用于分子診斷,但仍繼續用于檢測較小的遺傳變化以及不適合PCR擴增的較大重復變體擴展。但最近在應用中,多重連接依賴性探針擴增分析取代Southern印跡。除了標準副本編號變體,MLPA可以檢測到鑲嵌突變以及甲基化狀態。此外,MLPA可用于確認由FISH或CGH檢測到的結構異常。然而,在大多數情況下MLPA未檢測均衡基因組重排,如易位或倒位,這是相當大的限制,考慮到出射實現這些類型的人類遺傳疾病事件的。對于某些類型的遺傳損傷,例如大的三核苷酸擴增,包括Southern印跡和MLPA在內的經典分子方法將仍然是首選的檢測方法。
   NGS使用功能強大的大規模并行測序測定法對許多感興趣的基因,整個外顯子組或整個基因組進行測序,以分析各種罕見和復雜疾病的變異。基因組測序之前的靶向外顯子捕獲有助于對基因組大多數編碼區進行高效分析,而WGS評估幾乎所有的人類常色基因組。WES已被證明是對一些突變導致孟德爾病的快速且準確的發現方法。基因組測序的直線下降成本降低低于Sanger測序一些候選基因的試劑費用,使得WES的應用和WGS經濟上可行的。目前,WGS在臨床上尚不可用,但是WES可以從某些臨床實驗室獲得。臨床WES的解釋是有限的,很少有報道的結果可用于臨床。但是,主要學術中心的醫學遺傳學家現在經常為無法解釋的遺傳疾病提供咨詢和訂購WES。盡管兩種技術之間的選擇主要是由成本決定的,但是在將WGS作為臨床服務提供之后,WGS有望在未來幾年中取代WES,至少在資金雄厚的領域中會如此。自然,與所有破壞性技術一樣,WGS數據將比WES提出新的挑戰,即解釋可能導致患者表型遺傳負荷增加的非編碼變異。在某些情況下,可以采取基于可疑綜合癥的靶向NGS方法,以最小化成本并最大化變異識別。除了其在WES和WGS使用用于診斷和發現,NGS可以用于檢測甲基化狀態,可變剪接,小RNA,特異性等位基因的表達,甚至單倍型和重排。盡管尚未針對WES和WGS以外的其他應用程序進行全面審查,但NGS可能會成為其他“組學”應用程序的強大平臺。
   盡管出于成本考慮,但在臨床環境中使用WES和WGS的主要實際障礙是該技術可靠地檢測突變是否存在的有限能力。不同測序平臺已經顯示出提供可變質量的結果,工具在單獨的基本呼叫和其他覆蓋基因組的更寬范圍的更精確的。靶向方法,包括特定的基因組和整個外顯子組,可能具有更高的分析敏感性,但限制臨床敏感性與WGS相比,可能會將解釋范圍限制在編碼病變上。即使這樣,目前仍不可能從整個人類基因組甚至是常染色體的基因組中獲得高質量的序列,足以進行詳盡的臨床解釋。此外,為了有效地解析測序數據,WES和WGS的診斷工作通常包括對先證者和未受影響的父母進行三人測序,以有效地確定從頭開始的遺傳突變,并在有限的信息范圍內確定遺傳模式。現行的WES臨床測試中的解釋僅限于從頭開始和先前報道的變體,一些臨床WES實驗室僅對先證者進行測序,并在父母中確認感興趣的變體。在解釋遺傳變異方面,與生物親屬的接觸仍然很有價值。為了進一步完善海量數據,通常采用先證者和家屬的Sanger測序進行確認測試。隨著市場力量和臨床需求推動該領域的發展,WES和WGS的技術挑戰將得到解決。但是,仍然存在嚴重的解釋性問題,這些問題取決于初始基因組分析的范圍。綜上所述,這些技術的經濟和分析約束將限制WES和WGS成為有吸引力的鑒別診斷的第一步,需要進行二次確認,并可能需要一段時間才能通過其他方法進行平行測試。
   成功的情況下在WES的罕見疾病是有希望的;然而,由于其前所未有的規模和解釋性挑戰,常規的臨床基因組測序充滿了復雜性。多重可靠的解釋和從頭變種通過NGS發現將需要額外的經驗,并驗證其達到大規模診所之前,特別是對復雜性狀的診斷。盡管如此,臨床實施WES和WGS的可能變換臨床基因檢測,特別是在全基因組數據整合到電子醫療記錄。在這種轉變發生之后,專門的由表型驅動的測試可能會消失,并最終消失,而分子診斷將專注于對現有數據的解釋。直到最近,遺傳數據仍未推動診斷,但起著主要的確認作用。此外,對致病性病變的了解通常會導致基于人群的關于可能的患者預后的爭論。一個主要的挑戰是將致病的遺傳數據轉換為主要的診斷工具,再結合臨床觀察和生物統計數據,可以主動制定臨床決策和長期管理。大多數新興的臨床基因組測序范例都集中在狹窄的表型譜帶上,以詳細探究其遺傳結構。一種更廣泛的方法,即對與表型無關的變異體的總負荷進行測序和解析,將對一個核心問題做出有意義的貢獻:腫瘤基因檢測網應該對每位入院的患者進行測序嗎?在臨床診斷基因檢測中,美國醫學遺傳學家學院建議將變體分配給以下六個類別之一:“引起疾病”:先前已經報道了序列變異,是引起該疾病的公認原因;“引起疾病的可能性”:序列變化以前尚未見報道,并且是預期會導致疾病的類型,通常在已知的疾病基因中發生;“可能引起疾病”:序列變化以前尚未見報道,其類型可能是該疾病的原因,也可能不是該疾病的原因;“不太可能引起疾病”:序列變化以前尚未見報道,可能不是引起疾病的原因;“非致病性”:序列變異先前已有報道,是公認的中性變異;“未知的臨床意義變量”:未知或預期序列變異是導致疾病的原因,但已發現與臨床表現有關。變體中的大多數都需要根據文獻,人群頻率,臨床發現,突變數據庫以及可能的個案研究數據進行補充解釋。另外,變體可以被認為是保護性的或與藥物反應有關。
   自從分子診斷學問世以來,解釋稀疏記錄的缺乏基因突變的遺傳突變一直是具有挑戰性的,這在歷史上一直依賴于遺傳的分離模式,變體的統計發生率以及非人類物種中氨基酸改變的保守性。為了使這個問題進一步復雜化,負責分配分子發現重要性的實驗室很大程度上是根據該實驗室在目標分析物中的經驗來做出決定的。當前對WES和WGS數據的攻擊要求與詳細表型或臨床適應癥相關的變體進行復雜而透明的交換。以疾病為中心的變異數據庫已演變為人類疾病變異數據庫,對于記錄臨床變異非常有價值和手動管理的數據庫ClinVar和MutaDatabase。通過集中的努力,這些后繼試點人員可以擴展到更廣泛的,有針對性的交流中,以促進對全球不同平臺和實驗室之間稀有和常見變異的解釋。與數百喪失功能的變種和成千上萬的未知變種的意義在每個人的基因組,優先變種仍然是一個主要挑戰。遺傳過濾器是溫和的價值,并與感興趣變種的清單很短,有可能富集特定變體,分析多個家庭成員,審查計算算法的一致性和解析病態的人和小鼠基因組為變化。附加罕見的等位基因也可以相比人類疾病基因和模式生物數據庫。狹窄的方法未能考慮到來自WES或WGS實驗的潛在臨床有用數據,并且由于各種原因而遭受較高的假陰性率。通過這種技術和每個儀器固有的技術偏差。
   即使在單一基因或罕見疾病的情況下,變異解釋仍然是有問題的,因為相當一部分等位基因具有較差的預測價值,而修飾位點等位基因即使可能具有深遠的表型效應,也常常被排除在考慮范圍之外。這個問題在全基因組數據中得到了放大。目前,對于等位基因以前沒有與人類病理學相關或其中有被限制的生物洞察,在計算機芯片上預測算法代表常見的解釋來源,此類分析可以納入臨床報告。由于兩個主要原因,這是有問題的。首先,通常情況下,這種解釋是從表面上進行的,而沒有意識到每種算法的局限性和局限性。其次,社區對于每個程序的特異性或敏感性沒有度量標準,無法就可能的假陽性和假陰性解釋提供指導。目前僅在研究環境中使用的一種解決方案是部署生理相關的功能測定,實質上是“功能化”病態的人類基因組。這些工具已經存在的疾病,最顯著的代謝性疾病,線粒體功能障礙的一小部分等極少數的其他條件。此外,從蛋白質穩定性研究到轉錄活性以及等位基因和基因特異性動物模型的研究都已多次用于調查等位基因的致病潛力。相關的臨床發現突變。然而,沒有臨床實驗室能夠或不進行這種測試,將功能注釋納入結果的臨床級解釋中仍然是挑戰。沒有預料到這樣的非人類研究將成為真正的臨床試驗的時間,因為它們不僅會保持昂貴,勞動密集,難以自動化并且難以在人類突變的背景下進行解釋,而且它們不在人類的研究范圍之內。美國現有監管指南的范圍。希望臨床測試實驗室可以與功能建模實驗室合作,以告知變異發現。可以制定共識指南來注釋患者基因組中鑒定的數百個獨特和稀有等位基因及其功能后果,其方式將允許對基因組變異進行更好的解釋,并將此類注釋引入EMR中,以供患者使用和健康使用管理。
   WES和WGS在臨床中的應用已適當地產生在社區相對于輸送和一般上醫生,患者信息和社會的影響相當大辯論。許多已考慮到的提供給研究參與者的基因組信息的倫理問題,但較少知道關于在臨床環境中的影響。討論兩個關鍵問題:如何處理全基因組數據中的次要發現和遺傳隱私問題。與新興的臨床遺傳技術保持同步需要專門的遺傳培訓以及對訂購和接收遺傳學測試結果的患者和臨床醫生進行廣泛的遺傳知識培訓。事實上,在美國遺傳學素養非常小學缺少經過醫療培訓。總體而言,美國公眾從遺傳決定論的角度看待遺傳學。為了使公眾對多基因遺傳和復雜性狀有更深入的了解,中小學遺傳學教育必須超越“一個基因,一個表型”孟德爾遺傳的數學并包含復雜繼承的概念。基因組科學到臨床應用的實現需要臨床醫生在遺傳學和基因組被充分地精通以防止這些測試的結果是被誤解或濫用。遺傳咨詢師在遺傳學專業中的獨特作用對于翻譯遺傳學和基因組學概念非常有價值。然而,缺乏受過該角色訓練的專業人員,因此需要集中式遠程醫療來提供廣泛的遺傳學服務。最近為將遺傳學課程推向醫學和護理學校以吸引專業人才的努力,成功地發展了護理和醫學領域的核心遺傳學能力。監管基因檢測繼續挑戰試圖保護患者和消費者免受誤導基因組技術濫用的當局。這不是一個新問題,而是一個繼續使美國用于規范分析和診斷測試的現有模型復雜化的問題以及世界各地。隨著診所中WES和WGS的出現,這些挑戰在某些方面成倍增加。首先,當在一次臨床測試中分析成千上萬種分析物時,用于調節測試的特定于分析物的模型不再可行。此外,監管機構的負擔正在演變為一種監管規范,而不是監管結果的解釋,而對于基因檢測,監管機構的權限尚不明確。
   直到最近,醫師和患者的信息交換一直是不對稱的,即使不是家長式的:患者應遵循醫師規定的方案。但很顯然人們上網會在線尋求醫療信息,反駁的想法,想病人所想只有信息或沒有超過規定的方案少量。腫瘤基因檢測網也知道,“眾包”病人網站的崛起滿足需要未以其他方式由傳統的醫療保健系統遇到了。期望資金以進行罕見疾病檢測或創建在線社區,從而成為個人層面遺傳學解釋不可或缺的一部分。目前的證據表明,大多數人想知道他們的基因檢測結果,并希望在選擇是否以及如何訪問這些信息。隨著公眾對基因服務的關注和關注的增加,以及遺傳專家篩選信息的可用性下降,患者可能會尋求自己的信息收集方式。隨著基因組測序進入臨床領域,必須開發一種方法來傳達相關發現,以最好地為臨床實踐提供信息,同時對基因決定論的危險保持警惕。看來會產生表型的遺傳變異也可能取決于環境因素,修飾基因,表觀基因組學以及多種變異的累加和協同效應。在臨床翻譯中,即使是簡單的基因檢測結果也可能會被誤解。因此,至少可以說,傳達具有多種解釋的復雜基因組結果具有挑戰性。在美國,臨床遺傳診斷的可用性取決于開發實驗室測試和支付實驗室服務的實用性。臨床診斷實驗室主任選擇適合現有吞吐平臺,最大程度地提高效率和成本,并避免競爭最少的開發測試。持有基因專利或通過競爭實驗室必須通過限制測試開發對此類知識產權的基因檢測的好處獨占許可和產品實驗室。較新的技術會帶來驗證用于臨床的新型平臺的額外費用,而WES和WGS特別會在長期數據存儲和解釋基因組變異的信息學方面承擔大量費用。由付款人的遺傳測試服務償還取決于證據臨床效用的水平,這樣的服務的對臨床決策的影響和基因檢測的用于診斷的成本效益。在這些經濟限制下,鑒于驗證和能力測試的費用,對罕見疾病的診斷測試在商業上不如對常見疾病的測試有利可圖。臨床診斷的整合付諸實踐取決于正被考慮用于測試的專業,但臨床決策支持工具引入測試選項住院和門診工作流程,特別是在重要的電子病歷。
   測序成本的持續侵蝕,通過現有的技術和化學改進的容量增加,以及單分子第三和第四代測序的出現在部分驅動的,例如納米孔測序,表明在整個時間里,大多數進入衛生保健系統的患者將在臨床評估之前對其基因組進行測序。因此,將從根本上改變基因檢測的組成,以側重于個人,其近期和長期需求,其個人選擇和環境中的基因組數據的解釋。這將不是一夜之間的革命,尤其是因為尚有一段時間,新興的基因組技術必須具有足夠的質量和足夠低的成本,才能為世界上大多數無法獲得高質量醫療服務的人群使用關心。幾乎可以肯定,與測序信息的準確性有關的技術問題將很快得到解決。但是,對于解釋方面的挑戰卻并非如此。盡管對解釋范式的詳細討論值得在基礎科學,臨床醫生和政策制定者之間進行詳細的學術研究和深入討論,但重要的是要強調一些關鍵點。科學界一直非常關注表型極端的排序,遺傳結構的衍生模型以及這些極端的等位因果關系,現在正在尋求將這些模型疊加到普通人群上。鑒于腫瘤基因檢測網目前對疊加在基因組其余部分的遺傳背景上的單個等位基因的影響了解甚少,因此這些假設為時過早。腫瘤基因檢測網現在了解到,每個人都可以攜帶數十個無意義的突變,其中一些似乎位于被認為對生物學功能至關重要的基因中。但是,在其他等位基因,表位等位基因和環境暴露的背景下,從臨床相關性中丟棄此類等位基因可能存在根本缺陷。同樣也感到困惑的是,以母體胎兒血為指導工具對產前缺陷進行測序的方法存在缺陷,因為這種努力仍基于遺傳因果關系的狹隘觀點。鑒于根據基因型預測表型結局的能力有限,因此提供先發制人的指導可能是災難性的。患者軸承在M390R等位基因BBS1可能沒有表型,可能發展為孤立的視網膜變性或可能經歷了Bardet-Biedl綜合征的全譜。最后,可變外顯和可變表現度保持在臨床管理和解釋尖銳的問題,遺傳基礎,其中必須更充分的理解,提高WGS數據的臨床應用。
   腫瘤基因檢測網強烈建議對患者和對照人群進行系統研究,在該研究中,應使用詳細的臨床信息和生理相關的生物學檢測方法對基因組數據進行系統注釋。建議這些活動對于充分了解人類病理學的遺傳結構以及提高計算預測算法的有效性至可以放心地在臨床環境中執行這些點將是必要的。最后,在討論應該傳遞什么信息以及如何傳遞信息的過程中,腫瘤基因檢測網必須努力避免遺傳例外主義和威脅家長式的做法。相反,腫瘤基因檢測網應該致力于促進臨床實驗室與患者之間交流注釋遺傳信息的雙邊交流機制和政策,并進行清晰的評估,以評估此類數據的不足和風險。

 
腫瘤基因檢測網
  腫瘤基因檢測網,致力于將基因檢測前沿產品帶給大家,通過網站、微信、快遞等平臺,建立起患者和基因檢測機構之間直接溝通的橋梁,省去醫院、醫生、醫藥銷售代表等中間成本,以非常實惠的價格,享受非常前沿的技術,一起戰勝癌癥。
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